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公路交通
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开发区的公路比较发达，开发区全部区域，包括未开发区域都铺设公路，开发区紧邻京津塘高速和五环路，加之2006年修通的荣华北路和成寿寺路使得驾车从开发区进入城区的速度和线路都增加很多。
目前开发区来往市区和其他区域的主要道路为：
成寿寺路（包括西环北路，三台山路），向北可至三环路
博大路，向北可至四环路
京沪高速，向北可至三环路
五环路（荣华桥，亦庄桥）
北京绕城高速（马驹桥）
通马路（至通州区，京津高速公路）
公共交通
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北京亦庄新城现代有轨电车T1线驶经荣昌东街
开通于2010年12月30日的北京地铁亦庄线作为开发区来往北京城区的主要公共交通方式。该线路北起与 █ 5号线、 █ 10号线交汇的宋家庄站，南至亦庄火车站。2020年12月31日开通的亦庄有轨电车T1线成为开发区第二条轨道交通线路。2021年12月31日开通的北京地铁17号线成为开发区第三条轨道交通线路。
京津城际铁路途径北京经济技术开发区（225平方公里范围）并设亦庄站，2024年9月29日正式开办客运业务。
自动驾驶示范区
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2020年9月，北京市提出以北京经济技术开发区全域（60平方公里）为核心建设的北京市高级别自动驾驶示范区，同时在经开区设置智能网联汽车数据交互与应用国家平台[5]。2021年4月，北京市在经开区设立中国首个智能网联汽车政策先行区[6]。